Помогите выбрать научную статью для поста

[andresol]

Раз в год я вспоминаю, что у меня есть PhD по химии, и читаю одну недавнюю статью, а заодно пишу о ней в жж, чтобы лучше запомнилось. Пролистал вчера текущие номера ведущих химических журналов и скопировал ссылки на заинтересовавшие меня статьи. Прочитать их все у меня нет времени, поэтому прошу помощи у тех моих друзей, кто хочет почитать о химии, выбрать статью для чтения и разбора в блоге. Кандидаты следующие:

1. Биосинтез стрихнина - оказывается, учёные до сих пор не знали, как получается это вещество в растениях. Американский молекулярный биолог Сара О’Коннор (не родственница героини «Терминатора»), работающая в Германии, смогла выяснить очередные детали биосинтеза и опубликовать их в «большом» Nature. Меня всегда занимало, как эволюция создала столько ферментов для синтеза очень специализированных веществ:



2. Вторая статья тоже имеет дело со стрихнином, но в ней больше истории науки и философии. Эссе в ACS Central Science от известного историка органической химии Джеффри Симана «Кто установил структуру стрихнина?» самим своим названием показывает, что не всё так однозначно, как пишет Wikipedia (“The structure of strychnine was first determined in 1946 by Sir Robert Robinson”):



3. Интерес к этой недавней статье в JACS возник не только у меня – у неё более 6000 просмотров на сайте журнала. Португальский химик Нуну Маулиде из университета Вены предложил новый способ стереоселективного синтеза алкенов из илидов серы. Но я не представляю, как можно рассказать об этой работе людям, которые никогда не слышали о реакциях Виттига и Кори–Чайковского (не композитора). Для них этого будет 43-й способ получения того, для чего уже существует 42 метода:



4. Я был рад увидеть, что мой знакомый Алексей Сергеев, с которым мы вместе были постдоками в Беркли, продолжает публиковаться в JACS. Я отправился делать мобильные приложения, а Алексей остался заниматься химией в Ливерпуле. Статья любопытная, но если бы не личное знакомство, я бы её в этот пост не включил: химия снова слишком академическая – селективная активация орто-C–H связей в аренах без функциональных групп с помощью иридиевого комплекса:



5. Зато всем более-менее понятно, когда учёные пытаются открыть новые лекарства. От проверки концепции до таблетки в аптеке путь огромный, но мой глаз зацепился за
статью Элизабет Нолан из MIT, где она пришила противораковое лекарство цисплатин к химической штуке, которая специфично связывается бактериями, и получился новый антибиотик. «Хэви-метал троянский конь», как она его назвала:



6. В прошлом году я написал в жж о статье Дэвида МакМиллана, а он взял и выиграл осенью Нобелевскую премию. Если пытаться повторить подобное предсказание, то надо рассмотреть одну из статей Омара Яги из Беркли. Например, о том, как ловить углекислый газ из воздуха с помощью «ковалентных органических каркасов». Практической пользы у такого подхода ноль, но бороться с глобальным потеплением нынче модно:



Такие вот кандидаты. Пишите в комментариях, какая статья вам наиболее интересна (моему брату никакая не интересна). А если вы знаете другую важную статью, о которой я обязан высказаться, кидайте ссылку.

Comments

[kilativ.livejournal.com]

Мне как биологу занимающимся среди прочего бактерияальной устойчивостью к антибиотикам, интересно про цис-платин. Кроме того, меня им кололи, как имоего деда (успешно в обоих случаях)

[andresol.livejournal.com]

Спасибо за комментарий. У цисплатина ещё и интересная история открытия. У этой конкретной статьи есть тот минус, что она единственная не в open access, но если она победит на голосовании, то попробую её достать.

[tatotu.livejournal.com]

Я тоже за эту статью

[esya.livejournal.com]

2

[andresol.livejournal.com]

Спасибо, принято.

[egovoru.livejournal.com]

Присоединяю свой голос за номер 2. Помню, как потрясла меня кракозябристая молекула стрихнина в курсе биоорганической химии в университете :)

[andresol.livejournal.com]

Принято. Как химик-органик я знаю, что стрихнин ещё не самый кракозябристый, но в заголовок этого эссе недаром вынесена цитата “For Its Size, the Most Complex Natural Product Known.” В 1940-е он химиков шокировал и интриговал.

[vsparrow.livejournal.com]

Тем, кто ни черта не понимает в химии (вот например мне), видимо будет интересен пункт 2. Знакомое по детективам слово "стрихнин", история открытия... образцовый научпоп "для самых маленьких".

Остальное - скорее вызов, "смогу ли я рассказать об очень специальной штуке людям, ничего в теме не понимающим". Если интересны вызовы, то я бы почитал про 3, например - кто такие алкены? Зачем они нам? Зачем изобретать 43-й способ?

[andresol.livejournal.com]

Спасибо, понятно. Разделю ваши голоса по 0,5 каждой из двух статей.
У меня сейчас именно желание разобрать одну статью – на это должен день уйти, не больше. А научпоп-пост, чтобы всем было интересно, надо неделю готовить. Я думал к такому формату вернуться или даже на целую книгу замахнуться, но пока столько времени у меня нет.

[agasfer.livejournal.com]

Плюсану за 2. Цисплатина с энтеробактином, это как "крыса с зубами, отравленными цианистым калием" из фильма Ле Магнифик (Великолепный) :))

Кстати, недавно мне вдруг приснилась химическая формула, три пиридиновых кольца симметрично слитые вместе, с одним общим азотом в центре. Погуглил, и да, таки описан синтез примерно такой фигни, но вроде ничего замечательного.

[andresol.livejournal.com]

Добавил ваш голос за 2.
Химики любят симметричные молекулы, обычно у них интересные теоретические или спектральные свойства. Если бы та молекула, которую вы описали (https://pubchem.ncbi.nlm.nih.gov/compound/Pyrido_2_1_6-de_quinolizine), попалась бы мне в современной литературе, то я бы с большой вероятностью такой статьёй заинтересовался, но она была уже получена в 1969 году. С ней интересный вопрос, будет она ароматической или антиароматической. Но не настолько интересный, чтобы о ней была, например, отдельная статья в Wikipedia (или вообще она в Википедии упоминалась).

[lipkalapka.livejournal.com]

Для людей наверное про синтез лекарств актуальнее, а мне, как физику интереснее про стереоселективность.

[andresol.livejournal.com]

Спасибо за голос. Я эти статьи смотрел только на уровне абстрактов, не знаю, насколько авторы изучали механизм селективности. В органической химии любят постфактум делать квантовые расчёты, которые подтверждают экспериментальные факты, но так как считать можно очень многими разными методами с разной степенью приближения, то часто это подгонка метода под эксперимент, а не реальное объяснение, почему оно так происходит.

[polenadisto.livejournal.com]

Мне было бы интересно про стрихнин, причем как 1, так и 2.

[andresol.livejournal.com]

Хорошо, записал. Эссе номер 2 пока уверено лидирует. Что, наверно, неудивительно: история и философия науки интересны более широкому кругу читателей, чем узкоспециальная реакция. И стрихнин – сам по себе бренд.

[annum-per-annum.livejournal.com]

Тоже за стрихнин.

А про чудесную молекулу псилоцибина будет когда-нибудь? Может, даже с приложением в виде трип-репорта?

[andresol.livejournal.com]

Про стрихнин в моём списке две статьи. Разделил ваш голос пополам.

Если встретиться какая-то интересная с химической точки зрения история о псилоцибине, то, может, напишу. Молекула как молекула, не хуже других. Но всякой наркоте и так слишком много внимания уделяется. Я понимаю, что в глазах обывателей химия – это «яды, взрывы, наркотики», но мне тоже должна быть тема интересна.

[2born.livejournal.com]

А можно первые две в комплексе? :)

[andresol.livejournal.com]

Я посмотрю, но у меня обычно бывает так, что я начинаю одну статью читать и понимаю, что про неё одну можно 2-3 поста написать, а не так, что две статьи в один пост умещаются. Было бы время и желание, на примере стрихнина можно целую книгу об истории и методах органической химии написать. Популярная молекула.

[sergevanbrabant.livejournal.com]

Я голосую за номер 5. Но и второй тоже интересен.

[andresol.livejournal.com]

Спасибо, учту ваш голос за 5, а за 2 и так много голосуют, пока всё идёт к тому, что читать мне эссе об истории установления структуры стрихнина.

[dent.livejournal.com]

5 и 6 выглядит интереснее прочих

[andresol.livejournal.com]

Хорошо, принял.

[ein-arzt.livejournal.com]

Про "усовершенствование" цисплатина.

[andresol.livejournal.com]

Спасибо, записал себе в табличку.

[rempi.livejournal.com]

6. MOFы в целом интересная тема безотносительно применений. Красивая геометрия, топология и т.д.

[randomisator.livejournal.com]

Ну строго говоря там COFы, а не MOFы. Но они не менее красивы, так что я тоже за них.

[m-cardholder.livejournal.com]

1 or 3

[andresol.livejournal.com]

Записал. Но тебе-то понятно хочется более серьёзной химии, а народ в своей массе за историю или медицину.

[dashberger.livejournal.com]

Голосую за 5.

[andresol.livejournal.com]

Спасибо. После вашего голоса статья о цисплатине вышла в лидеры в моём голосовании. Кто победит, я пока не знаю, но интерес к цисплатину учту в любом случае.

[grihanm.livejournal.com]

Я за 2 или за 6. Подкинь монетку. Про какую нибудь работу Яги я и сам хочу обзорчик сделать как нибудь. И да, за каркасы рано или поздно дадут.

[andresol.livejournal.com]

Я по 0,5 голоса каждой статье добавил.
Раз в прошлом году Нобеля дали за органику, то я ожидаю, что в этом дадут за физическую или биологическую химию людям, о которых я впервые услышу. Но если вдруг дадут Яги, то я буду считать, что снова угадал.

[mevamevo.livejournal.com]

Любой интересный материал будет интересен! :)

[andresol.livejournal.com]

Спасибо. Я эти статьи только мельком просмотрел. Бывает, что начнёшь читать, а ничего интересного для поста в них не окажется. Но пока две статьи (2 и 5) вырвались в лидеры в голосовании. Для меня стало проще отсеять то, что читать не надо.

[freedom_of_sea.livejournal.com]

а что там с биосинтезом например кокаина и можно ли эти вкусные гены пересадить в дрожжи?

[andresol.livejournal.com]

Биосинтез кокаина настолько изучен, что отдельная статья в Wikipedia есть: https://en.wikipedia.org/wiki/Biosynthesis_of_cocaine.
Но сама молекула намного проще стрихнина. Мне кажется, что даже если бы его легализовали, получать кокаин все равно было бы проще всего из растительного сырья. Или полным синтезом из простых доступных молекул.

Сейчас погуглил: в 2020 году в Nature выходила статья о получении тропановых алкалоидов в дрожжах: https://www.nature.com/articles/s41586-020-2650-9 и https://news.stanford.edu/2020/09/02/scientists-turn-yeast-cells-drug-factories/ ("Stanford engineers reprogram yeast cells to become microscopic drug factories"). Сам кокаин они делать не стали, но упоминают.

[chemma-volkova.livejournal.com]

Я за номер 6. Люблю, когда сама химия простая (типа обычного амидного кауплинга), а получаются полезные и интересные вещи, плюс потом легко отмасштабировать/включить в производство. Обычно подобные проекты очень элегантные, такая гениальная простота.
(Хотя чтобы уменьшить СО2 надо просто увеличить его захват растениями, например, почистить наконец воду, чтобы этим занимались водоросли).

[andresol.livejournal.com]

Спасибо, после твоего голоса 6 подтягивается к текущим лидерам голосования (2 и 5).
С природным фотосинтезом всем этим искусственным методам захвата тягаться тяжело. Но сам факт, что исследования MOF/COF можно притянуть к глобальному потеплению, может помочь им Нобеля выиграть. Они больше заслужили, чем асимметрический органокатализ, которому в прошлом году дали.

[tamgdenasnet.livejournal.com]

Я за номер 5. Статью внимательно читать нет времени, но картинка уже вызывает вопросы: куча катехольных групп и четырехвалентная платина. Я не говорю уже, что продукт восстановления, двухвалентная платина, должна замечательно комплексоваться этими же катехольными группами, числом три на одну бедную платину.

[andresol.livejournal.com]

Записал.
Я тоже дальше абстракта не читал. Не знаю, как они характеризовали платиновые комплексы в бактериальной среде. Может, там не так важно, какие на платине лиганды сидят? Достаточно её селективно в бактериальные клетки доставить, а дальше она им что-нибудь в любом состоянии поломает. Если эта статья победит (шансы у неё хорошие), попробую найти ответы на эти вопросы.

[kokainetto4ka.livejournal.com]

наверное, 2

[andresol.livejournal.com]

Спасибо. Сейчас у 2 стало 7 голосов, а у 5 — 6,5.

[almakedonskij.livejournal.com]

я настолько мало понимаю в химии, что вряд ли тут чем могу помочь, но главное проще для обывателя )
про нобелевку )

[andresol.livejournal.com]

Я со статьёй 6 упомянул возможную Нобелевку. Её могут Яги никогда и не дать. В голосовании победила статья 2 об истории установления структуры стрихнина, которая рассказывает о двух давних нобелевских лауреатах, вчера начал её читать.