andresol: (Default)
[personal profile] andresol
Сегодня я хочу поставить под сомнение ценность проведения некоторых органических реакций в воде. Но для начала объясню, почему меня заинтересовал данный вопрос.



Как я недавно написал, в июле я поеду в Санта-Барбару на Graduate Research Seminar. Окончательная программа, кто и когда докладывается, еще не известна. Но у меня есть копия e-mail’a, посланного организаторами всем еще не названным участникам. Так в частности я вычислил Джоша и уже поговорил с ним в пятницу: если у меня есть e-mail'ы, то есть имена, а значит и возможность заочно познакомиться со статьями всех приглашенных аспирантов. Мне нравится поражать людей неожиданными познаниями в их научных проектах.

Первым по алфавиту стоял некто Александр Абела из группы Брюса Липшутца из самой Санта-Барбары. (Наверно, слегка обидно, когда конференция проходит в твоем же городе; это как в случае международных олимпиад по химии: кто-то едет в далекие экзотические страны, но кто-то отправляется на олимпиаду в Москву, как было в 1996 и 2007 годах). Получил он бакалавра в Стэнфорде в 2005 году, что весьма странно, так как на симпозиум приглашены аспиранты четвертого года, то есть начавшие PhD программу в 2007-ом. Чем он два года занимался? В армии служил?

Под руководством Липшутца и с помощью старших товарищей Александр опубликовал к настоящему времени 4 статьи (всякие приглашенные обзоры и обзорчики не считаются): две в Org. Lett.: раз, два; одну в Angewandte; и одну
в JACS’е.

Вот я решил все четыре в воскресенье прочитать. Химия на первый взгляд показалась не особо разнообразной (мои карбен-бораны со стороны не кажутся все на одно лицо), вращающейся вокруг биарильных сочетаний, катализируемых палладием. Вроде уже и Нобеля за них дали, а люди все продолжают копаться в деталях и оптимизировать уже переоптимизированное. По крайней мере, ссылки только на основные обзоры и непосредственно похожие статьи занимают немалую часть этих коротких публикаций. Они и сами быстро собрали по 30-40 цитирований, хотя я почти наверняка уверен, что это цитирования из серии «мы их работу не повторяли, но они тоже работают над C–H активацией арилмочевин».

Но вначале они изучали классическое сочетание Сузуки–Мияюры: арил галогенид + арил бороновая кислота.

Новая фишка заключалась в том, чтобы провести реакцию при комнатной температуре в воде. И если первая проблема была решена с помощью хитроумных катализаторов (не ими придуманных, да и сами катализаторы были подарены фирмой, а не синтезированы), то вот растворимость в воде была повышена внесением нейтральных амфифилов: молекул, состоящих из длинного полярного полиэтиленгликолевого хвоста, присобаченного к чему-нибудь липофильному. То есть реакция шла не совсем в воде, а в эмульсии: в мицеллах, образуемых амфифилом.

В общем, экспериментально работа несложная: сиди и гоняй многочисленные сочетания между коммерчески доступными исходниками в стеклянных пендюрках. В таких случаях я говорю: «Сколько нужно примеров, чтобы я поверил в реакцию? Достаточно одного хорошего примера». Они же расщедрились и на 20 и на 30 примеров, не всегда блещущих разнообразием. Наприиеер, две Org. Lett. статьи отличаются только тем, что в первой реакции проводятся с карбоциклическими арилами, а во второй в тех же условиях сквашиваются гетероциклические арилы. Оставим за скобками вопрос, многому ли научится аспирант на таком проекте, и перейдем непосредственно к заявленной «зелености» продемонстрированной химии.

В введении и выводах к статьям всячески подчеркивается, как это здорово, что реакция идет в воде, а не в противном вонючем органическом растворителе. Мол, они эти растворители составляют большую часть токсичных отходов, а сейчас реакция пошла в воде, и настало счастье. «Не так быстро», – заявляю я. Сама по себе идея перенести реакции в воду добавлением ПАВ интересная, хотя, наверняка, не новая, но к «зелености» и «экологичности» имеет настолько опосредованное отношение, что я бы о них умолчал.

Во-первых, насколько чиста такая вода после проведенной реакции? Не становится ли она сама токсичным отходом, который к тому же сложнее уничтожить или переработать, чем многие органические растворители.

Во-вторых, я абсолютно согласен, что львиную долю отходов составляют растворители (и еще силикагель). Но не те растворители, что используются для проведения реакций, а те, которые льются во время хроматографий, мойки посуды, экстракций. Это еще Карран подмечал: «Пишут, что химия зеленая-зеленая, реакция в 2 мл воды, а потом бух – и на колонке продукт выделяют, выливая по литру петролейного эфира и этилацетата». Вот рассматриваемые работы как раз классический пример того, что сэкономили 2 мл орг. растворителя на реакции, а потом потратили 500 мл на хроматографическую очистку.

В-третьих, я так и не понял, чем им не нравятся водно-органические среды. Раз уж все равно добавляют 2 весовых процента некоей органики, то почему бы не добавить 10% более дешевого этилового спирта. Реакция может пойти ничуть не хуже. Между прочим, в чистой воде они получили 75% конверсии против 96% с ПАВом. Так как выходы не проверяемы и принимаются на веру, то у меня возникают мысли, а нельзя ли поэкспериментировать с теми же катализатором и основанием, чтобы получить 100% конверсию в чистой воде.

В-четвертых, я бы постеснялся называть «зеленой» реакцию, в которой плавает палладий, 3 экв. триэтиламина (да на 2 мл воды у них 0.42 мл этого вонючего амина – очень «зеленая» химия в «воде»), а в последующих статьях по С–Н активации к ним добавляются ацетат серебра AgOAc (2 экв.), бензохинон (5 экв.) и даже тетрафтороборная кислота HBF4 (5 экв.). Растворитель тут далеко не самая опасная штука.

Кстати, те же катализаторы тоже надо синтезировать. Истинный енвайерменталист мыслит глобально и сравнивает: есть легко доступный и дешевый катализатор, выходы 80%, но надо греть при 120 oС, и есть дорогой катализатор, который надо синтезировать из первого в несколько стадий (со всеми соответствующими потерями и отходами), но выходы 95%, и реакция идет при комнатной температуре.

Так что меня эти постоянные ссылки на «зеленость» в научных статьях (а не в пресс-релизах) раздражают. Понятно, что хочется произвести впечатление на налогоплатильщиков, но Org. Lett. читают и решения по грантам принимают химики, а не фермеры из Оклахомы. Отсюда же идут «наномицеллы» вместо старых добрых мицелл. Да, все мы понимаем, что это только начало пути, и авторы жаждут выразить свои благородные помыслы как можно раньше, но я не разделяю их энтузиазма: в начале пути молчи – хвастаться будешь, когда доберешься до цели. Я тоже могу много чего рассказывать о «зелености» карбен-боранов, но чаще я предпочту честно сказать, что они представляют лишь академический интерес.

В промышленных масштабах все, конечно, по-другому. Хроматографию там не жалуют. Но сомневаюсь, что условия Липшутца будут широко применяться в будущем. Работа интересна как раз таки академической идеей, что ПАВ может ускорять реакции неполярной органики в полярных средах. Из нее в будущем может выйти практический толк, если уже где-нибудь не вышел.

Или я не прав и это замечательные прогрессивные статьи, истинные образчики «зеленой» химии?

Date: 2011-05-25 04:57 am (UTC)
From: [identity profile] arby3ik.livejournal.com
Абсолютно согласен. Помню, меня несколько озадачила "зелёная хмимя", когда я вёл органопрактикумы у студентов. Очень часто в книге оперировали этим понятием совсем не к месту, а студенты писали что попало при ответах на вопрос о "зелёности" проделанной реакции. И на мой взгляд причина тому - сильная размытость этих критериев даже для занимающихся этим людей.

А касательно критерия "проведение реакции в воде" у меня совсем скептическое отношение. В Москве на производственной практике (синтез всяких смазок покрытий) активно используют именно органические легкокипящие растворители. Потому что затраты энергии на перегонку пяти тонн воды (для очистки) и, например, пяти кубометров дихлорметана несопоставимы. Да и техническая реализация схемы очистки гораздо проще. О растворимости органики в воде я вообще молчу.

Date: 2011-05-25 05:01 am (UTC)
From: [identity profile] andresol.livejournal.com
Спасибо за высказанное мнение. Я против настоящей зеленой химии ничего плохого не имею. Сам не люблю со всякой ртутью или оловоорганикой работать. Но это должно быть настоящее улучшение, а не своеобразный "химический софизм", где за громкими словами об уменьшении отходов скрывается горькая правда.

Date: 2011-05-25 05:43 am (UTC)
From: [identity profile] whiskymaker.blogspot.com (from livejournal.com)
+100500

В воде действительно многие реакции идут быстрее. Но потом все равно продукт надо из воды экстрагировать. Получается используем ту же органику, но в больших объемах + имеем кучу водных отходов. Ничего зеленого в такой технологии нет. И такое ощущение, что рецензенты в приличных журналах этого не понимают.

Date: 2011-05-25 05:48 am (UTC)
From: [identity profile] andresol.livejournal.com
Они, кстати, подчеркивают, что их условия - это не то же самое, что шарплессовское "on water". Им не сколько ускорение нужно было, а сам факт, что растворитель - вода. Для классического Сузуки разработаны сотни условий, и получение высокого выхода продукта не представляет собой большой проблемы. Если бы я был рецензентом, то, возможно, попросил бы авторов смягчить "экологическую риторику" во введении, но статью опубликовать бы дал. Если предоставится возможность, то на конференции спрошу самого Александра, что он думает по этому поводу.

Date: 2011-05-25 06:48 am (UTC)
From: [identity profile] buches.livejournal.com
наверное это Zymes проплатил (http://www.zymes.com/), которые за "discovering and creating innovative technology to help humankind". В обоих org letters в acknowledgements Zymes, LLC горячо поблагодарён за финансовую поддержку и сурфактант, и в обоих же org letters в тексте присутствуют "green" и "environmental" (т.е. экологичные они), в то время как в jacs и angewandte этой лабуды нет.

если пофантазировать: у компании есть деньги и мозги, они связались с профом, дали сэмплы и денег на студента, обрисовали идеал химии которые их сэмплы отстаивают ну и вперед :)

Date: 2011-05-25 01:20 pm (UTC)
From: [identity profile] andresol.livejournal.com
Это очень хорошая версия, и она все мне многое объясняет. Я и сам слегка удивился, что Org. Lett. статьи спонисированы какой-то фирмой, а не NIH, к примеру (как JACS и ACIE). Только Липшутц сам является Co-founder and Executive Vice President of Research and Development at Zymes, так что даже никому не пришлось ни с кем связываться. Просто аспиранта первого года попросили поработать на благо профессорской группы и подкинуть им пару публикаций.

Главная же заявленная цель у фирмы - накормить людей синтетическим coenzyme Q10 (CoQ10). Я, кстати, читал интервью Липшутца, где он жалуется, что все знают о важности витамина С (и ссылается на сомнительную агитацию Полинга), но никто не говорит о важности жрать синтетиеческий CoQ10, чтобы жить долго.

Date: 2011-05-25 01:39 pm (UTC)
From: [identity profile] buches.livejournal.com
о, проверить то что Липшутц сам там affiliated - мне это в голову не пришло.

тогда возникает логичный вопрос о необходимости упоминания о competing financial interests. И кстати, я только что посмотрел, ACS требует такого упоминания в своих ethics guidelines (стр 3, пункт 12: http://pubs.acs.org/userimages/ContentEditor/1218054468605/ethics.pdf,). Судя по тому, что в статье об этом ни слова, можно предположить, что авторы, помня о своей ответственности, упомянули об этом в cover letter. Но при желании, конечно, можно и придраться.

Большое спасибо за этот пост.

Date: 2011-05-25 03:24 pm (UTC)
From: [identity profile] andresol.livejournal.com
Да, действительно на лицо не раскрытый конфликт интересов. Мой руководитель, профессор Карран, в каждой статье по fluorous chemistry обязательно дает пояснения:

(10) (a) Precursors for the silyl tags and fluorous HPLC columns for the demixing
were purchased from Fluorous Technologies, Inc., www.fluorous.com. (b)
DPC owns an equity interest in this company.

Даже тогда, когда FTI напрямую не спонсирует исследования. Правило общее: упоминаешь название своей фирмы - добавь строчку о том, что это твоя фирма.

Но сейчас этот аспирант работает над С-Н активацией и полтора года ничего не публиковал. Думаю, что на конференции он эти первые статьи в Org. Lett. не будет упоминать, но посмотрим, и если что, спросим.

Date: 2011-05-25 02:04 pm (UTC)
From: [identity profile] rizya.livejournal.com
про воду все знают и давно об этом пишут 10.1002/anie.200604952
но едва ли что-то скоро поменяется. если уж отцы пишут про зеленую химию, то чего ждать от ребят попроще или совсем попроще - вроде китайцев. рецензент не поправил потому что у него у самого десять таких же статей, тут к гадалке не ходи

Date: 2011-05-25 03:14 pm (UTC)
From: [identity profile] andresol.livejournal.com
Меня, возможно, больше всего и возмутило, что серьезный профессор подает пример того, что якобы нужно писать о глобальных вызовах и проблемах, иначе статью не примут. А на самом деле, как прояснилось в предыдущем комменте, Липшутц пиарил свою компанию Zymes, LLC, которая дала деньги на исследования. Мол, компания выглядит солиднее, если спонсирует исследования, опубликованные в ведущих журналах.

Спасибо за ссылку на эссе, сейчас прочитаю.

Date: 2011-05-25 07:09 pm (UTC)
From: [identity profile] andresol.livejournal.com
Прочитал эссе - все те же мысли, что и у меня, только еще красивее и убедительнее расписано. Удивительно, как после его публикации в 2007 году можно принимать статьи со столь нелепыми восхвалениями воды в качестве "зеленого" растворителя.

Возможно, потом по результатам дискуссии я сделаю апдейт, в том числе дам ссылку на эссе и приведу некоторые цитаты.

Date: 2011-05-26 12:47 am (UTC)
From: [identity profile] rizya.livejournal.com
в коментах дискуссия такая дискуссия, все очень бескомпромиссные принципиальные чуваки, все против очковтирательства, это радует.
Ценное и в воде тоже есть, для гипотетической реакции которую потом надо экстрагировать или кристаллизовать - даже и для нее все равно явным образом ставить лучше в воде а не пиридине нмп или дмф хотя они все и стоят в сущности копейки. все равно в воде приятнее будет, хотя и не зеленая ни разу химия, но смысл изучать есть.
Так же и с потеплением, если отбросить больных которые пишут про комплексы непосредственно в контексте парникового эффекта, то все равно чтобы бороться с потеплением надо сперва научиться СО2 фиксировать, а так как девать его потом толком некуда будет если все же научимся, то есть смысл заниматься рогатыми комплексами которые в перспективе что-то смогут делать с ним полезное. редко встретишь академическую статью в которой честно написано про академический интерес, но что делать.

А за последние лет 5 я наверное штуки 4 видел таких эссе, - мол, неправильно живем. со всеми согласен, но ничего не поменялось конечно. это мнение меньшинства, и оно идет вразрез с новыми трендами. Эссе процитировали 145 раз, но если эти статьи открыть (я открыл первые 5 думаю остальные в том же ключе) то будет ржака.
(deleted comment)

Date: 2011-05-25 07:11 pm (UTC)
From: [identity profile] andresol.livejournal.com
Вот и мне показалось, что само по себе добавление ПАВ не ново. Не знаю, применял ли кто его именно для Сузуки, но это уже частности, тем более, если ранее была показана общность эффект и объяснен его механизм. Что же выходит, эти Org. Lett. статьи вообще ничего нового не привносят?
(deleted comment)

Date: 2011-05-26 05:43 pm (UTC)
From: [identity profile] andresol.livejournal.com
В качестве контроля у них была реакция в воде без ПАВ. Конверсия в тех же условиях составила, если им верить 75% (выход не определялся). Если бы ждали не 6 часов, а 20, то могли бы те же 96% получить. То есть конкретно для этой реакции улучшение не выглядит очень значительным. Мой личный взгляд, что для Org. Lett. это слабовато (учитывая, что они опубликовали как минимум три однотипных статьи: две по Сузуки с гетероциклами и без и одну по Хеку - условия не менялись), но редактору виднее.
(deleted comment)

Date: 2011-05-27 04:47 am (UTC)
From: [identity profile] andresol.livejournal.com
В статье, где описан катализатор (Org. Lett. 2004, 6, 3731-3734), все выходы высокие (в ДМСО, ДМФ и т.д.). К примеру в воде-этаноле (1:1) арил хлориды (более упрямые субстраты) при 80 oС дают выходы в 100%. Арил бромиды дают 100% даже с такими простыми катализаторами как (Cy3P)PdCl2. Статья, правда, тоже написана сотрудниками фирмы, которая этим катализатором торгует (они же подарили его Липшутцу), так что высокие выходы им были необходимы. С другой стороны, продавая катализатор, они готовы за них отвечать.
(deleted comment)

Date: 2011-05-27 10:42 pm (UTC)
From: [identity profile] ph-below-7.livejournal.com
В людей его всё-таки не льют.
(deleted comment)

Date: 2011-05-25 07:19 pm (UTC)
From: [identity profile] andresol.livejournal.com
Меня больше всего раздражает, когда какой-нибудь рогатый органометаллический комплекс, который вне главбокса не живет, связывает CO2, а авторы начинают статью с обсуждения проблемы глобального потепления. Секвестируйте углекислый газ Гриньярами, если уж вам так хочется.

Мы тут выше в комментах выясняли, что Org. Lett. статьи спонсировало не государство, а фирма самого Липшутца. Видать, это фирме потребовалась поддержка в виде настоящих научных статей, чтобы привлекать инвесторов. В статье, кстати, о подобном конфликте интересов ни слова.

В многостадийном академическом синтезе ни о какой green chemistry речь не идет. На последней стадии объемы такие, что всем пофиг, насколько растворители и реактивы ядовиты. Но да, это не добавляет популярности многочисленным методологическим статьям о реакциях в воде. Я бы вообще отдельно считал все цитирования и полезные цитирования (то есть те, где реакция была повторена). У многих статей по hot topics с общим цитированием в несколько десятков, полезное цитирование стремилось бы к нулю.
(deleted comment)

Date: 2011-05-25 10:49 pm (UTC)
From: [identity profile] andresol.livejournal.com
Когда синтезы идут на тонны, то весьма разумно попытаться заменить ту же хлорорганику на просто органику. Но там уже задачи для инженеров-химиков. А с водой все ясно: теперь я буду по умолчанию записывать минус всем, кто будет в своих статьях называть ее "зеленым растворителем".
(deleted comment)

Date: 2011-05-25 07:21 pm (UTC)
From: [identity profile] andresol.livejournal.com
Мне тут выше ссылку дали на хорошее эссе по этой же проблеме ACIE, 2007, 46, 3798-3800: http://onlinelibrary.wiley.com/doi/10.1002/anie.200604952/abstract.

Там тоже приходят к очевидному выводу: “Thus, in many cases, a comparative analysis will conclude that an organic-solvent-based process is cheaper, easier, and ultimately environmentally more sound than a water-based organic reaction is.”

по теме

Date: 2011-05-26 12:08 pm (UTC)
From: [identity profile] evgeny-bykow.livejournal.com
Коллеги я теоретик,но за колбами когда-то тоже стоял. Я думаю, что условия "зелёности" в полной мере осуществить трудненько и чаще всего, как пишут присутствующие, получается по принципу: "Нос вытащишь хвост увязнет и обратно". Ну в общем это чаще словесная уловка, типа приставки "нано" к чему ни попадя. А работы с ПАВами, которые благодаря гидрофильным "хвостам" позволяют перетащить реагенты в водную фазу, уже с такой "бородой", до которой моей ещё расти и расти...

Re: по теме

Date: 2011-05-26 02:11 pm (UTC)
From: [identity profile] andresol.livejournal.com
Спасибо за комментарий.

Действительно, дискуссии как таковой у нас тут не произошло, так как все комментаторы проявили единомыслие и здравомыслие, которых не хватило рецензентам журнала Organic Letters. Получился еще один хороший пример того, что к любым научным статьям надо относится с должным скептицизмом.

Date: 2011-05-27 10:49 pm (UTC)
From: [identity profile] ph-below-7.livejournal.com
Ну этот чувак доит одну и ту же корову, но вообще-то с CoQ есть более достойные примеры - Аркаша Красовский сделал Негиши в воде, что позволяет избежать стадии получения цинкорганики.

Date: 2011-05-27 11:33 pm (UTC)
From: [identity profile] andresol.livejournal.com
Да, возможно, я выбрал две неудачные статьи, сделанные first-year grad student'ом ради лулзов. Но меня интересовал именно этот студент. Липшутц - уважаемый и известный профессор, тем стренне было видеть от него столь беспомощную химию. О Красовском я слыхал, когда тот еще у Nicolaou работал, но лично не знаком и статей его не читал.

Date: 2011-05-28 09:59 am (UTC)
From: [identity profile] kurgus.livejournal.com
Да, несколько алогично получается: при масштабировании процесса такие многокомпонентные системы атехнологичны.
Использование триэтиламина в качестве растворителя - или его азеотропа с водой - упростило бы технологическую схему в настоящем производстве и в результате было бы гораздо зеленее, чем их водно-мицеллярная система.

И если уж говорить о совсем зеленой химии, то давайте вообще избавляться от растворителей - таким вот, к примеру, образом:  Waste-Free Solid-State Organic Syntheses: Solvent-Free Alkylation, Heterocyclization, and Azo-Coupling Reactions (//www.springerlink.com/content/4v63014r60612244/).

P.S. Оказывается, я занимался зеленой химией до ее появления: еще будучи студенотм, окислительно галогенировал имидазопиридины и пиримидины.
При комнатной температуре в воде (С) - и без брома/хлора :-)
Растворял сырые гидробромиды, получившиеся из бромкетона с 2-аминоазином, в воде и добавлял H2O2 - и на следующий день фильтровал выпавшее бромпроизводное.

Date: 2011-05-28 11:40 pm (UTC)
From: [identity profile] andresol.livejournal.com
Если смотреть глобально, то любое улучшение в ограническом синтезе по сути "зеленое", так как позволяет уменьшить число отходов. У синтеза в 5 стадий с выходом 30% отходов по идее должно быть меньше, чем у 10-стадийного синтеза того же продукта с выходом 10%. Но надо определенно смотреть на отдельные стадии. Сложно назвать "зелеными" реакции с соединениями ртути, селена и т.п. Вот их в первую очередь и надо замещать, а не ДМСО на воду.

Что же касается реакций без растворителя в "мельницах", то это интересное направление, однако, требует развития собственной химии, так как многие реакции, вроде тех же палладиевых сочетаний, трудно заставить идти в твердой фазе.

Date: 2011-05-31 01:07 am (UTC)
From: [identity profile] mithotyanochka.livejournal.com
зеленость нынче в моде, так что, конечно, всем хочется представить свою продукцию именно с этой точки зрения

January 2026

S M T W T F S
    1 23
456 78910
11121314151617
18192021222324
25262728293031

Most Popular Tags

Style Credit

Expand Cut Tags

No cut tags
Page generated Jan. 11th, 2026 07:59 am
Powered by Dreamwidth Studios