![[personal profile]](https://www.dreamwidth.org/img/silk/identity/user.png){kind=small}
andresol1. Возвращаясь к вчерашнему Synthetic Target, хочу показать тот путь, который предложил я.
Все превращения выглядят логично, но вот моя команда не поверила в возможность α-гидроксилирования карбоновой кислоты, пара других мест вызвала сомнения. В результате общая идея с Дильс–Альдером осталась, но вместо алкена, взяли алкин; α-гидроксилирование карбонильных соединений заменилось более привычным дигидроксилированием двойной связи. Число шагов составило 13 (11 – длиннейшая линейная последовательность), и синтез потерял свою элегантность. А ведь я уже отмечал, что ныне в полном синтезе намечается следующая тенденция: переберем хоть тысячу реакционных условий, но найдем способ заставить эту реакцию идти так, как надо, и соберем молекулу в восемь стадий, а не в двадцать пять.
Рано или поздно кто-нибудь акремостриктин синтезирует, хотя особой биологической активности он не показал и структурными особенностями не блещет. Тогда, если не забуду, посмотрю, какую стратегию изберут химики: скучную и осторожную, вроде тех, что мы обсуждали на встрече группы, или дерзкую и стремительную, как в моем блокноте.
2. Сегодня возле библиотеки, на фоне сосен, делали фото группы. Профессор решительно занялся обновлением нашего сайта. Снимала нас секретарь Хартвига Аннеке. После трех-четырех снимков она подбегала к профессору, показывала на экране фотоаппарата результат. Тот начинал переставлять нас, переставлять Аннеке, и мы фотографировались до тех пор, пока Хартвиг не остался удовлетворен полученным изображением. Требовательный человек требователен во всем. Кстати, я заметил, что Хартвиг всегда ходит в одинаковом черном свитере. Никогда не видел, чтобы он надевал что-нибудь другое. Наверно, живет как профессор Смит из известных комиксов.
3. По пятницам в 4 часа в Беркли семинар по неорганической химии (по вторникам в 11 утра по органической – на следующей неделе Эрик Джакобсен из Гарварда). Сегодня с предтеньюрным докладом к нам приезжал Todd Harrop из Университета Джорджии. Тодд и PhD делал по бионеорганической химии, и постдочил в MIT со Стивеном Липпардом, и в Джорджии, став самостоятельным профессором, решил никуда не отходить от моделирования активных центров никель- и железосодержащих ферментов. Так как собираюсь заняться родственными вещами, то на семинар пошел.
Впервые сидел в Pitzer Hall’е – большой аудитории на первом этаже Латимер-Холла. Из приятных вещей – несмотря на бедность, в Беркли проставляют бесплатное кофе и сэндвичи с арахисовым маслом для слушателей семинара. На заметку – если семинар объявлен в 4:00 pm, то начнут в 4:10 pm. В Питтсбурге всегда начинали минута в минуту. Шок – парты в аудитории разрисованы. В Питтсбурге я такого не видел и представить себе не мог. А тут такие родные надписи и рисунки ручкой.
Профессор Харроп весьма упитан и настроен доброжелательно. Я даже особо не спал и после лекции задал вопрос. А еще меня интересовало, что же Хартвиг не пришел. Интересовало до той поры, пока я не понял, что он сидел все время за мной. Когда возвращались в лабу, я и Ичен, один из наших аспирантов, стояли и ждали лифт. Кнопка не загоралась, но я уже привык, что в Беркли все сломано и разваливается. Ждали-ждали, плюнули и пошли другим путем. Только через час до меня дошло, что было уже полшестого и надо было вставить в панель управления лифтом ключ от здания.
Все превращения выглядят логично, но вот моя команда не поверила в возможность α-гидроксилирования карбоновой кислоты, пара других мест вызвала сомнения. В результате общая идея с Дильс–Альдером осталась, но вместо алкена, взяли алкин; α-гидроксилирование карбонильных соединений заменилось более привычным дигидроксилированием двойной связи. Число шагов составило 13 (11 – длиннейшая линейная последовательность), и синтез потерял свою элегантность. А ведь я уже отмечал, что ныне в полном синтезе намечается следующая тенденция: переберем хоть тысячу реакционных условий, но найдем способ заставить эту реакцию идти так, как надо, и соберем молекулу в восемь стадий, а не в двадцать пять.Рано или поздно кто-нибудь акремостриктин синтезирует, хотя особой биологической активности он не показал и структурными особенностями не блещет. Тогда, если не забуду, посмотрю, какую стратегию изберут химики: скучную и осторожную, вроде тех, что мы обсуждали на встрече группы, или дерзкую и стремительную, как в моем блокноте.
2. Сегодня возле библиотеки, на фоне сосен, делали фото группы. Профессор решительно занялся обновлением нашего сайта. Снимала нас секретарь Хартвига Аннеке. После трех-четырех снимков она подбегала к профессору, показывала на экране фотоаппарата результат. Тот начинал переставлять нас, переставлять Аннеке, и мы фотографировались до тех пор, пока Хартвиг не остался удовлетворен полученным изображением. Требовательный человек требователен во всем. Кстати, я заметил, что Хартвиг всегда ходит в одинаковом черном свитере. Никогда не видел, чтобы он надевал что-нибудь другое. Наверно, живет как профессор Смит из известных комиксов.
3. По пятницам в 4 часа в Беркли семинар по неорганической химии (по вторникам в 11 утра по органической – на следующей неделе Эрик Джакобсен из Гарварда). Сегодня с предтеньюрным докладом к нам приезжал Todd Harrop из Университета Джорджии. Тодд и PhD делал по бионеорганической химии, и постдочил в MIT со Стивеном Липпардом, и в Джорджии, став самостоятельным профессором, решил никуда не отходить от моделирования активных центров никель- и железосодержащих ферментов. Так как собираюсь заняться родственными вещами, то на семинар пошел.
Впервые сидел в Pitzer Hall’е – большой аудитории на первом этаже Латимер-Холла. Из приятных вещей – несмотря на бедность, в Беркли проставляют бесплатное кофе и сэндвичи с арахисовым маслом для слушателей семинара. На заметку – если семинар объявлен в 4:00 pm, то начнут в 4:10 pm. В Питтсбурге всегда начинали минута в минуту. Шок – парты в аудитории разрисованы. В Питтсбурге я такого не видел и представить себе не мог. А тут такие родные надписи и рисунки ручкой.
Профессор Харроп весьма упитан и настроен доброжелательно. Я даже особо не спал и после лекции задал вопрос. А еще меня интересовало, что же Хартвиг не пришел. Интересовало до той поры, пока я не понял, что он сидел все время за мной. Когда возвращались в лабу, я и Ичен, один из наших аспирантов, стояли и ждали лифт. Кнопка не загоралась, но я уже привык, что в Беркли все сломано и разваливается. Ждали-ждали, плюнули и пошли другим путем. Только через час до меня дошло, что было уже полшестого и надо было вставить в панель управления лифтом ключ от здания.
![[identity profile]](https://www.dreamwidth.org/img/silk/identity/openid.png){kind=small}
no subject
Date: 2012-01-28 10:31 am (UTC)можно поподробнее про акремостриктин и его био активность?
no subject
Date: 2012-01-28 06:35 pm (UTC)Про акремостриктин нельзя сказать очень много. Он описан в единственной статье http://pubs.acs.org/doi/abs/10.1021/np200707y, опубликованной в декабре прошлого года. Выделили его корейские ученые из морского гриба Acremonium strictum, отсюда и название. Причем гриб растет не сам по себе, а на некой морской губке, вид которой не удалось установить. Органические экстракты этой губки показали антимикробную активность, потому решили выделить активный антибиотик, благо оказалось, что гриб можно культивировать отдельно в лабе. Его растили и перемешивали в 120 колбах (по 100 мл культуры в каждой) при 28 ºС в течение трех недель. Потом долго экстрагировали, хроматографировали (первоначальный экстракт показал 21 пик различных веществ) и выделили 30 мг акремостриктина. Большая часть статьи посвещена установлению его структуры методами ЯМР и в конце концов рентгеном. Затем провели простейшие испытания на антибактериальную активность, и оказалось, что почти никакие бактерии акремостатин не убивает. Значит активность экстракта губки определялась какими-то другими веществами. Возможно, известными дикетопиперазинами (циклическими дипептидами), которые тоже были попутно выделены. Чтобы уж совсем не расстраиваться, корейцы проверили акремостриктин на антиоксидантную активность. Слабенькая активность действительно наблюдалась: акремостатин защищал клетки от смерти, вызываемой H2O2. Но такая активность характерна чуть ли для половины природных соединений, так что хвастаться тут нечем.
Для встречи группы молекула была выбрана, потому что она новая (нельзя подстмотреть уже существующие синтезы) и с синтетической точки зрения имеет идеальную для наших целей сложность: есть над чем голову поломать, но синтез получится достаточно коротким, чтобы доложить его за 10–15 минут.
no subject
Date: 2012-01-29 03:56 pm (UTC)) осталось запомнить все формулы и как-нибудь блеснуть на биохимии дополнительным материалом:)
no subject
Date: 2012-01-30 08:54 am (UTC)no subject
Date: 2012-01-30 09:51 am (UTC)no subject
Date: 2012-03-23 03:27 pm (UTC)no subject
Date: 2012-03-23 04:32 pm (UTC)