andresol: (Default)
[personal profile] andresol
Вчера на сайте журнала Dalton Transactions появилась моя последняя публикация. Больше от моих аспирантских исследований не осталось ничего ценного (хотя есть маленький шанс, что меня включат в соавторы еще одной статьи, но, скорее, не включат, да и в любом случае это будет не моя публикация). Мой нынешний проект идет столь вяло, что вряд ли будет опубликован. А в будущем я буду заниматься наукой без начальства и подчиненных, размещая все достойные и любопытные результаты в блоге, а не в архаичных научных журналах.

Чем еще замечательна эта статья, кроме того, что она последняя, тринадцатая в моем списке публикаций? Тем, что она опубликована в журнале английского RSC (Royal Society of Chemistry). В журналах ACS, Wiley и Elsevier у меня статьи были, а на RSC я не рассчитывал, так как мой питтсбургский руководитель профессор Карран в аглицких журналах публиковался крайне редко. Он признавался, что ему не нравится британская орфография, и вообще он член «Американского химического общества» и будет публиковать результаты в журналах своего общества. Почему же эта работа оказалась в Dalton'e? История началась почти три года назад.


В декабре 2009 года я изучал реакцию нуклеофильного замещения на атоме бора в карбен-боранах. Перебирая доступные нуклеофилы, я заметил на полке большую банку фенола. ОК, получим фенолят, заместим трифлат на боре, и будет у нас карбен-феноксиборан NHC-BH2OPh. Сказано-сделано, выделил на колонке продукт, но в спектре оказалось больше сигналов, чем нужно. Я вначале подумал, что привязалась какая-то примесь, но внимательное изучение спектров и очистка вещества перекристаллизацией указали на альтернативное объяснение: в продукт встроилась раскрытая молекула ТГФ, использовавшегося как растворитель. В целом, химикам и так все ясно из графического абстракта.

После этого я изучал эту необычную реакцию еще полтора года, пытаясь слепить из нее что-нибудь интересное. Поначалу нам виделась аналогия между нашей системой и так называемыми Frustrated Lewis Pairs (FLP), которые расщепляют молекулы похожим образом. Мы не стали публиковать свою находку вместе с другими реакциями «нормального» замещения. Я перебирал условия: фенол, основание, растворитель, время, температура – пытался понять, почему фенолят реагирует не так, как другие нуклеофилы. Аналогия с FLP становилась все более поверхностной. В итоге я расписал все результаты по раскрытию ТГФ в главу диссертации, защитился и отправился в Беркли.

Перед отъездом я отправил профессору Каррану вольно написанный черновик статьи, экспериментальные данные со спектрами и забыл о карбен-боранах. У руководства тоже накопились более срочные дела и статьи. Опасности, что кто-то нас опередит не было ни малейшей. Но раз вещества приготовлены, то данные должны быть опубликованы для того, чтобы их хотя бы химические базы проиндексировали. Карран передал работу над статьей нашему французскому коллеге Эммануэлю Лакоту. И вот в середине июля я получил от них письмо.

Редакция Dalton'а обратилась к Каррану с Эммануэлем с просьбой предоставить статью для спецвыпуска по химии бора. Вот они и решили пристроить туда «раскрытие ТГФ». Мой черновик был сокращен раза в два. Были выкинуты все менее интересные результаты, убрано возможное объяснение. Мои размышления начальство не убедили, и они сказали, что лучше никак не объяснять результаты, чем объяснять их неуверенно и провоцировать рецензентов.

А дальше пару месяцев шла традиционная работа над манускриптом. Что-то допиливаем, внимательно читаем заново, набирается список исправлений и пожеланий на три страницы, цикл повторяется. В итоге у рецензентов и редакторов вопросов не возникло, и вот статья опубликована.
(deleted comment)

Date: 2012-09-23 04:12 am (UTC)
From: [identity profile] andresol.livejournal.com
А оно должно быть? Можно синтезировать такие хрени NHC-BH2O(CH2)4OAr, а зачем они - это не наша забота.
(deleted comment)

Date: 2012-09-23 04:23 am (UTC)
From: [identity profile] andresol.livejournal.com
Мы нашли что данная штука есть. Применили ее для написания диссертации и статьи. А вот пользу этой реакции для сельского хозяйства пусть ищут агрономы.

Date: 2012-09-24 03:02 am (UTC)
From: [identity profile] magnitoz.livejournal.com
+1
Но есть так называемая фундаментальная наука - просто найти новое. Ну типа как новый астероид в астрономии - а кому он там надо всем без разницы :)

Date: 2012-09-26 04:51 pm (UTC)
From: [identity profile] kurgus.livejournal.com
Назначение любой реакции - войти в очередное издание очередных Губен-Вейлевских "Методов" :-)

Date: 2012-09-26 04:58 pm (UTC)
From: [identity profile] andresol.livejournal.com
Препаративное значение данного конкретного метода сомнительно, но одна из целей публикации - дать проиндексировать это превращение в SciFinder и Reaxys. Потому что если оно останется только в моей диссертации, то это равносильно тому, что никто никогда ничего не делал.

Date: 2012-09-26 06:43 pm (UTC)
From: [identity profile] kurgus.livejournal.com
Ну, индексация - дело святое.
А вот насчет препаративного значения - это смотря что вместо тетрагидрофурана раскрывать.
Ежели взять замещенные фуранозы/пиранозы, да что-нибудь вроде тиоглюкозы или биоактивно-тиольного в качестве нуклеофила, то если пойдет - интересные субстанции могут получиться.

Как там с токсичностью/биоактивностью карбенборанов?

Date: 2012-09-26 06:56 pm (UTC)
From: [identity profile] andresol.livejournal.com
Для раскрытия кислородных гетероциклов уже немало методов предложено. Я, кстати, пробовал раскрывать тетрагидропиран и тетрагидротиофен - ничего устойчивого не выделил. Оксетан (4-членник с кислородом) раскрывается, и это в статье есть.

Сами NHC-BH3, думаю, малотоксичны, а вот NHC-BH2OTf весьма реакционноспособен. Хотя никто их толком не тестировал. Мы как-то сдавали образцы устойчивых карбен-боранов и их производных в библиотеку для биологического скрининга, но протестировали их в итоге или нет, я не знаю.

Date: 2012-09-23 04:07 am (UTC)
From: [identity profile] doomdrake.livejournal.com
Кстати, довольно мудрая идея - не объяснять никак, чем пытаться это сделать неубедительно.

Date: 2012-09-23 04:16 am (UTC)
From: [identity profile] andresol.livejournal.com
Это не только мудро, но честно. Там было что-то тривиальное, вроде "влияние как стерических, так и электронных факторов". Мы представляем экспериментальные данные, а если теоретикам вдруг станет интересно, почему так происходит, то пусть предлагают разумные объяснения.

Date: 2012-09-23 04:43 am (UTC)
From: [identity profile] alleukemist.livejournal.com
А как же вы будете получать финансирование, не публикуясь в журналах?

Date: 2012-09-23 04:45 am (UTC)
From: [identity profile] andresol.livejournal.com
Первые годы - личные сбережения и помощь родственников (в первую очередь брата). А потом налажу собственный бизнес или подамся во фрилансеры. Главное, что я не хочу ходить ежедневно на работу и не хочу иметь начальства.

Date: 2012-09-23 01:28 pm (UTC)
From: [identity profile] steklosib.livejournal.com
Лучше бизнес, фриланс это как-то очень ненадежно. И у блогов в отличии от архаичных журналов увы импакт фактора нет, ну если только автор не будет большим авторитетом. И ссылаться на блоги тоже сложно. Зарегистрированная твердая копия, это все таки твердая копия.

Date: 2012-09-23 07:11 pm (UTC)
From: [identity profile] andresol.livejournal.com
Лучше бизнес, так как денег больше, а с какого-то момента на него можно не тратить время.
У блогов есть свои импакт-факторы: число подписчиков, активных комментаторов. В конце концов, даже сейчас крутое открытие может быть опубликовано в журнале с низким импактом, но если оно действительно крутое, то его заметят и отметят.
Ссылаться на блог не сложнее, чем на любой веб-ресурс. Все эти "год, том, страница" должны уйти в прошлое: ссылка - один клик - и я на месте.
Сейчас плодятся online журналы без твердой копии. SI никогда не попадает в печать.

Date: 2012-09-24 03:39 am (UTC)
From: [identity profile] buches.livejournal.com
в экспериментальной химии туговато так вот порвать с эстаблишментом. тягу и ямр-спектрометр в гараже же не соберешь. Может все-таки faculty в тихом месте, теньюр потихоньку, а там глядишь кансалтинг и занимайся себе чем хочешь, иногда преподавая.

Date: 2012-09-24 03:52 am (UTC)
From: [identity profile] andresol.livejournal.com
А может сразу в гроб? Никаких сделок с совестью. Если мне надоело заниматься химией, то чего комедию ломать еще много лет, врать в аппликэйшнах, выдавливать из себя пропозалы, которые сам не одобряешь?

В конце концов, ЯМР можно снимать по знакомству в соседнем универе, а все реакции проводить в воде, чтобы тяга не понадобилась (например, изучая origin of life). Или кооперироваться с профессорами-экспериментаторами. Были бы годные идеи, а решение найдется.

Date: 2012-09-24 03:54 am (UTC)
From: [identity profile] buches.livejournal.com
а так тебе химия надоела. А то я этого в явной форме не уловил и текста и проинтерпретировал соответственно.

в таких случаях перерыв/смена деятельности - твой выход.

Date: 2012-09-24 03:56 am (UTC)
From: [identity profile] buches.livejournal.com
да поизучай coursera.org, может что-то затянет новое. (сорри она меня так впечатлила что я не могу не упомянуть :))

Date: 2012-09-24 03:58 am (UTC)
From: [identity profile] andresol.livejournal.com
Вот когда разделаюсь с текущими обязательствами, поизучаю, что в этом мире происходит за стенами химической лаборатории. На самом деле уже планов громадье и уже пора бы не учиться, а самому делать проекты на подобие этой "Курсеры".

Date: 2012-09-24 03:59 am (UTC)
From: [identity profile] buches.livejournal.com
тоже верно. ты там считай в самом сердце креативного мира.

Date: 2012-09-24 04:01 am (UTC)
From: [identity profile] andresol.livejournal.com
Недавно накатал коммент по поводу усталости от химии на полторы страницы: http://marie-mari.livejournal.com/77709.html?thread=1001869#t1001869

Может быть, стоит перенести его в мой ЖЖ, так как там все сказано о моем нынешнем состоянии и настроении.

Date: 2012-09-24 04:10 am (UTC)
From: [identity profile] buches.livejournal.com
Конечно давай его в отдельный пост!

Date: 2012-09-23 09:20 am (UTC)
From: [identity profile] niktos12.livejournal.com
Кстати, про размещение результатов работы в блоге. Просто интересно как вы себе это видите: что-то вроде заметок в стиле лабораторного журнала он-лайн или все же как законченный, форматированный по типу статьи (введение, экспериментальная часть, результаты и т.д.), пост?

Date: 2012-09-23 09:22 am (UTC)
From: [identity profile] andresol.livejournal.com
И то, и то. Вначале какие-то обрывки, затем обобщающая работа. Но я планирую уйти из экспериментальной науки. Я бы не занимался экспериментом, даже если бы стал профессором, но на дому точно не буду варить никакую органику, чтобы борцы с наркотиками не замели.

Date: 2012-09-23 10:27 am (UTC)
From: [identity profile] d-s-p.livejournal.com
Неожиданно :)
1. Станете фрилансером чего? Если не секрет.
2. Как широкая общественность будет узнавать о том, что опубликовано в блоге? Как будет индексироваться?

Вообще интересная тема. Мне в классических публикациях сейчас заметно не хватает прикрепленного форума для обсуждения.

Date: 2012-09-23 07:17 pm (UTC)
From: [identity profile] andresol.livejournal.com
1. Секрет:) На самом деле сам не знаю. От научной журналистики до художественной литературы. С бизнесом как-то яснее: что-нибудь продавать.
2. Те, кому это надо, будут узнавать из своей френдленты. Широкая общественность узнает из новостей, если работа стоит того, чтобы о ней узнали. Например, об этой дальтоновской статье узнает очень небольшая группа людей.

Классическая публикация устарела. Нет открытого доступа, есть жесткое премодерирование, но почти отсутствует постмодерирование, многие статьи откровенно скучны и раздуты. Через 100 лет новые публикации будут смотреться как творчество Пушкина в сравнении с русской литературой 18 века.

Date: 2012-09-23 09:03 pm (UTC)
From: [identity profile] d-s-p.livejournal.com
Это страшно интересная тема для обсуждения - может быть сделаете отдельный пост со своей точкой зрения.

Мне кажется основная проблема блогов в их многочисленности и эфемерности. Из-за этого сложно индексировать и соответственно - искать. Есть еще сопутствующие вопросы авторства, приоритета по времени, и т.д.

"Классическая публикация устарела, многие статьи откровенно скучны и раздуты." - согласен. Однако, какой будет новая публикация - не очевидно.

Date: 2012-09-23 09:09 pm (UTC)
From: [identity profile] andresol.livejournal.com
Тема не только интересная, но и сложная, не разработанная. Какие-то мысли у меня на этот счет есть, но многое надо проверять на практике. А для начала нужно получить хороший научный результат, которым я могу единолично распоряжаться. Самое простое решение - залить на arxiv, который химики сейчас игнорируют, а в блоге дать развернутое объяснение. Но это, конечно, должен быть блог на английском, специально для этого предназначенный. Что-то вроде страницы группы.

Date: 2012-09-23 12:36 pm (UTC)
From: [identity profile] keiju-kulta.livejournal.com
Поздравляю с публикацией! А у меня наоборот, живу и работаю в Англии, а статьи публиковала пока только в журналах ACS и Elsevier, и только третью статью планирую отправлять в RSC Chemical science, когда наконец закончим с манускриптом))

Date: 2012-09-23 07:19 pm (UTC)
From: [identity profile] andresol.livejournal.com
У каждой группы свои предпочтения, где публиковаться. И не всегда можно увидеть какую-то логику в выборе журнала. Chemical Science - самый крутой в RSC. Удачи!

Date: 2012-09-23 01:10 pm (UTC)
From: [identity profile] kulinkovich.livejournal.com
А в чём, собственно, изюмина? В кислотно-катализируемом расщеплении ТГФ?

Date: 2012-09-23 07:27 pm (UTC)
From: [identity profile] andresol.livejournal.com
Была бы какая-то изюмина, отправили бы в JACS, а не в Dalton.

Лично мне было интересно, почему этого расщепления не происходит с другими нуклеофилами. Например, PhSLi или NaCN в ТГФ дают продукты прямого замещения на боре NHC-BH2SPh и NHC-BH2CN. Исчерпывающего ответа я дать не могу, но существует корреляция с pKa сопряженной кислоты нуклеофила. Возможно, ion pairing играет роль, делая одни нуклеофилы объемнее, чем другие, и тем самым не давая им атаковать атом бора. Но мы все эти ничем не подкрепленные рассуждения в итоге выкинули и оставили только экспериментально полученные данные.

Date: 2012-09-23 09:41 pm (UTC)
From: [identity profile] kulinkovich.livejournal.com
В jacs cтатеек с муляжом вместо изюма пруд-пруди, а вот умеренная самоирония и самокритика встречаются не часто. Такой ответ на провокационный вопрос можно только приветствовать.

Date: 2012-09-24 05:16 am (UTC)
From: [identity profile] dotearth.livejournal.com
> А в будущем я буду заниматься наукой без начальства и подчиненных, размещая все достойные и любопытные результаты в блоге, а не в архаичных научных журналах.

На всякий случай, может будет интересно:
http://www.ted.com/talks/michael_nielsen_open_science_now.html

Date: 2012-09-24 07:53 am (UTC)
From: [identity profile] andresol.livejournal.com
Спасибо. Оказалось, что я эту лекцию уже когда-то смотрел. Они попробовали решить проблему прямолинейно, и пока у них получилось не очень впечатляюще. Конечно, я буду учитывать подобный пионерский опыт.

Date: 2012-10-02 06:21 am (UTC)
From: [identity profile] marie-mari.livejournal.com
я очень люблю дальтон, но у меня с ним связаны грустные воспоминания. мы написали туда статью, мой шеф сделал последнюю правку и отправил. рецензенты сказали, что статья интересная, но так, как она написана, им будет сниться в кошмарах. например, шеф сказал, что вставит картинку электрофореза, написал "эелектрофорез приведен на схеме", а схемы нет. нужно было просто переписать. за четыре года статья так и не была опубликована. можно уже забить на нее.

Date: 2012-10-02 06:47 am (UTC)
From: [identity profile] andresol.livejournal.com
Если результаты интересные, то таких шефов надо пинать регулярно, хоть четыре года подряд. Я тоже не знал, когда и где эта работа будет опубликована. У Каррана бывает и пара лет проходит перед публикацией, но на это обычно есть свои причины.

April 2026

S M T W T F S
   123 4
5678910 11
12131415161718
1920 2122232425
2627282930  

Most Popular Tags

Style Credit

Expand Cut Tags

No cut tags
Page generated Apr. 27th, 2026 06:25 am
Powered by Dreamwidth Studios