Первая публикация: Supporting Info
Nov. 10th, 2012 08:01 pm![[personal profile]](https://www.dreamwidth.org/img/silk/identity/user.png){kind=small}
andresolХотел бы упомянуть еще несколько вещей, имеющих отношение к моей первой публикацией, но не вошедшие в основной рассказ.
1. Техника безопасности (а точнее ее отсутствие)
Когда я работал в Боулинг Грине, я нарушил столько правил техники безопасности, что сейчас я бы такому андеграду лично уши надрал. Но тогда все обошлось. Я не носил защитных очков, я работал один по ночам, я не подписывал никаких журналов ПТБ. Я работал на приборах, к которым не получил официального доступа: мне Дима показал, что нажимать, и вперед. Просто удивительно, что я им ничего не сломал и не разбил.
Я не знал, что можно пользоваться шприцами и микрошприцами. Поэтому амины добавлял по весу. Весы, соответственно, стояли вне тяги. Поныне самый противный запах, что я когда-либо чувствовал, у пирролидина. Я задерживал дыхание и прикапывал заветное количество вонючей жидкости. Может быть, все-таки хорошо, что я работал один?
Зато по русской традиции я все время носил халат. И Дима привил мне привычку надевать резиновые перчатки. В СПбГУ к ним прибегали только если работали с бромом или хромкой. Я помню, как на втором-третьем курсе у меня несколько раз на руках сходила вся кожа. А в перчатках можно было безбоязненно тыкать пальцем в любую органическую бяку. Работать в перчатках мне настолько понравилось, что я продолжил их надевать и на пятом курсе, вернувшись в Питер. Старшие товарищи отнеслись к этому как к блажи и буржуйству, а младшие – переняли эту вредную привычку.
2. О цитируемости
На настоящий момент первоначальная 2007 JOC статья была процитирована 8 раз, а статья 2010 Tetrahedron – всего один раз. Я, признаюсь, читал не все статьи, их цитирующие. В большинстве случаев это обзоры или другие методы по синтезу бензотиофенов, где на нас ссылаются среди других литературных предшественников.
Статья в Tetrahedron’е с правильной структурой – единственная моя публикация в журналах издательства Elsevier. Даже не знаю, можно ли ее считать моей, учитывая историю ее появления. Но для коллекции я считаю и всегда указываю в своем CV.
Когда я вычислял свои цитирования для грин-карты, я, конечно, учитывал и эти боулинг-гриновские статьи. Но во всяких научных жизнеописаниях, вроде Research summary при подаче на постдока, я стал называть тот проект синтез aminobenzo[b]thiophenes, не указывая 2- или 3-. И схему рисовал, конечно, с правильной формулой продукта. Хотя если бы кто-то решил докопаться до истины и открыть оригинальную статью 2007 года, то он не мог бы не заметить существенное отличие.
3. 2′-Хлорацетофенон vs. 2-хлорацетофенон
Исходник для реакции был получен нитрованием 2′-хлорацетофенона (KNO3/H2SO4). И с тех пор я хорошо запомнил, чем отличаются 2-хлорацетофенон и 2′-хлорацетофенон.
Это знание мне пригодилось через три года, когда я писал в питтсбургской аспирантуре экзамен по гетероциклической химии. В одном из вопросов исходное вещество было ошибочно названо 2-бромацетофеноном, хотя по логике должен был быть 2′-бромацетофенон. Я решил блеснуть знаниями и написал, что реакция не идет. Профессор Випф, увидев, что я не нарисовал структуру продукта поставил мне 0 баллов за этот вопрос, но я с легкостью отапеллировал полный балл, указав, что условие было некорректное: просили 2-бромоацетофенон, я его и нарисовал.
В статье мы называли вещество без штрихов 1-(2-chloro-5-nitrophenyl)ethanone, как предлагает ChemDraw. Тут не запутаешься, хотя этанон звучит кривовато.
4. Middle initial
Начиная с питтсбургских аспирнатских публикаций, я решил убрать из своего имени в списке соавторов центральную “Y.”. Без него смотрится лучше и читается проще (а не Андрей «почему?» Соловьев). А вы оставляете первую букву своего отчества в своих англоязычных статьях?
В группе Некерса принято размещать фотографии выпускников на стене над ротационным испарителем.
5. One-pot
Это популярное словечко в название нашей статьи “One-Pot Synthesis of Substituted 2-Aminobenzo[b]thiophenes” Дима вставил совершенно напрасно. One-pot применимо, когда две и больше стадий проводят без выделения промежуточного продукта, в одной и той же колбе, просто добавив новый реагент и часто даже не сменив растворитель. Наш же процесс технически одностадийный. Мы все смешали, погрели и выделили продукт. Диму на это слово натолкнул первоначальный дизайн реакции: ацетофенон в тиоамид, затем циклизация в бензотиофен. То, что оно сразу зациклизовалось без выделения тиоамида, и было по мнению Димы тем самым one-pot. Сейчас-то мы знаем, что там и тиоамида никакого не образовывалось.
6. Механизмы
Ну, и для самых любопытных предложенные Димой механизмы тех реакций в том виде, как они опубликованы в Tetrahedron’е (журнал богатый, не обеднеет, если я пару картинок позаимствую для образовательных целей).
1. Техника безопасности (а точнее ее отсутствие)
Когда я работал в Боулинг Грине, я нарушил столько правил техники безопасности, что сейчас я бы такому андеграду лично уши надрал. Но тогда все обошлось. Я не носил защитных очков, я работал один по ночам, я не подписывал никаких журналов ПТБ. Я работал на приборах, к которым не получил официального доступа: мне Дима показал, что нажимать, и вперед. Просто удивительно, что я им ничего не сломал и не разбил.
Я не знал, что можно пользоваться шприцами и микрошприцами. Поэтому амины добавлял по весу. Весы, соответственно, стояли вне тяги. Поныне самый противный запах, что я когда-либо чувствовал, у пирролидина. Я задерживал дыхание и прикапывал заветное количество вонючей жидкости. Может быть, все-таки хорошо, что я работал один?
Зато по русской традиции я все время носил халат. И Дима привил мне привычку надевать резиновые перчатки. В СПбГУ к ним прибегали только если работали с бромом или хромкой. Я помню, как на втором-третьем курсе у меня несколько раз на руках сходила вся кожа. А в перчатках можно было безбоязненно тыкать пальцем в любую органическую бяку. Работать в перчатках мне настолько понравилось, что я продолжил их надевать и на пятом курсе, вернувшись в Питер. Старшие товарищи отнеслись к этому как к блажи и буржуйству, а младшие – переняли эту вредную привычку.
2. О цитируемости
На настоящий момент первоначальная 2007 JOC статья была процитирована 8 раз, а статья 2010 Tetrahedron – всего один раз. Я, признаюсь, читал не все статьи, их цитирующие. В большинстве случаев это обзоры или другие методы по синтезу бензотиофенов, где на нас ссылаются среди других литературных предшественников.
Статья в Tetrahedron’е с правильной структурой – единственная моя публикация в журналах издательства Elsevier. Даже не знаю, можно ли ее считать моей, учитывая историю ее появления. Но для коллекции я считаю и всегда указываю в своем CV.
Когда я вычислял свои цитирования для грин-карты, я, конечно, учитывал и эти боулинг-гриновские статьи. Но во всяких научных жизнеописаниях, вроде Research summary при подаче на постдока, я стал называть тот проект синтез aminobenzo[b]thiophenes, не указывая 2- или 3-. И схему рисовал, конечно, с правильной формулой продукта. Хотя если бы кто-то решил докопаться до истины и открыть оригинальную статью 2007 года, то он не мог бы не заметить существенное отличие.
3. 2′-Хлорацетофенон vs. 2-хлорацетофенон
Исходник для реакции был получен нитрованием 2′-хлорацетофенона (KNO3/H2SO4). И с тех пор я хорошо запомнил, чем отличаются 2-хлорацетофенон и 2′-хлорацетофенон.
Это знание мне пригодилось через три года, когда я писал в питтсбургской аспирантуре экзамен по гетероциклической химии. В одном из вопросов исходное вещество было ошибочно названо 2-бромацетофеноном, хотя по логике должен был быть 2′-бромацетофенон. Я решил блеснуть знаниями и написал, что реакция не идет. Профессор Випф, увидев, что я не нарисовал структуру продукта поставил мне 0 баллов за этот вопрос, но я с легкостью отапеллировал полный балл, указав, что условие было некорректное: просили 2-бромоацетофенон, я его и нарисовал.
В статье мы называли вещество без штрихов 1-(2-chloro-5-nitrophenyl)ethanone, как предлагает ChemDraw. Тут не запутаешься, хотя этанон звучит кривовато.
4. Middle initial
Начиная с питтсбургских аспирнатских публикаций, я решил убрать из своего имени в списке соавторов центральную “Y.”. Без него смотрится лучше и читается проще (а не Андрей «почему?» Соловьев). А вы оставляете первую букву своего отчества в своих англоязычных статьях?
В группе Некерса принято размещать фотографии выпускников на стене над ротационным испарителем.
5. One-pot
Это популярное словечко в название нашей статьи “One-Pot Synthesis of Substituted 2-Aminobenzo[b]thiophenes” Дима вставил совершенно напрасно. One-pot применимо, когда две и больше стадий проводят без выделения промежуточного продукта, в одной и той же колбе, просто добавив новый реагент и часто даже не сменив растворитель. Наш же процесс технически одностадийный. Мы все смешали, погрели и выделили продукт. Диму на это слово натолкнул первоначальный дизайн реакции: ацетофенон в тиоамид, затем циклизация в бензотиофен. То, что оно сразу зациклизовалось без выделения тиоамида, и было по мнению Димы тем самым one-pot. Сейчас-то мы знаем, что там и тиоамида никакого не образовывалось.
6. Механизмы
Ну, и для самых любопытных предложенные Димой механизмы тех реакций в том виде, как они опубликованы в Tetrahedron’е (журнал богатый, не обеднеет, если я пару картинок позаимствую для образовательных целей).
![[identity profile]](https://www.dreamwidth.org/img/silk/identity/openid.png){kind=small}
no subject
Date: 2012-11-11 05:00 am (UTC)Мне еще не нравится, что "Y." похож на "V." И вообще, у тех же китайцев обычно нет middle initial'а. И мы без него проживем.
no subject
Date: 2012-11-11 04:51 am (UTC)no subject
Date: 2012-11-11 05:03 am (UTC)no subject
Date: 2012-11-11 05:01 am (UTC)no subject
Date: 2012-11-11 05:04 am (UTC)no subject
Date: 2012-11-11 05:06 am (UTC)no subject
Date: 2012-11-11 05:11 am (UTC)no subject
Date: 2012-11-11 05:12 am (UTC)no subject
Date: 2012-11-11 05:17 am (UTC)Вторую мне показали перед публикацией. Имя там было переврано, инициал стоял. Имя я поправила, а про инициал даже не задумалась. Какая в общем-то разница? Эстетически мне совершенно без разницы.
no subject
Date: 2012-11-11 05:12 am (UTC)3 выпендрежник ;-) почти как бывалый лицейский вхкшник прям :-) Хотя я очень понимаю желание так сделать ;-)
Если бы я сейчас могла, то добавила бы какой-нибудь хитрый двойной миддл инишиал, чтобы поисковые системы типа глупого веб-оф-ноледж отличали меня от других с таким же набором инициалов. Но уже всяко поздно, поэтому пусть хоть так будет. Мне лично кажется, что это единственная цель указывать букву отчества, не могу подумать о еще какой-то причине.
Ненавижу механизмы! У меня на них аллергия!
no subject
Date: 2012-11-11 05:18 am (UTC)3. Такой красивый случай представился, что я не удержался:) Ведь я сразу понял, что я про это мелкое различие знаю, а профессор - нет.
Вот уж не знаю, много ли людей ищут меня во всяких WoS. Если мне важно, чтобы человек знал список моих публикаций, то я пришлю ему свое CV. А если кто-то хочет поиграть в сыщика, то пусть играет, распутывает.
Это еще нестрашные механизмы, но крайне спекулятивные.
no subject
Date: 2012-11-11 05:33 am (UTC)А ты думаешь, что та же гифт-карточная организация тебя не серчила ни по какой базе данных? А так, мне вот самой иногда интересно посмотреть что поменялось в цифрах, индексах, цитированиях, а так как число публикаций медленно, но верно растет, очень неприятно, когда на мое имя выползают какие-то непонятные мурзилки на русском языке о чем-то совершенно нерелевантном. Что люди подумают...
Так и хочется подойти и спросить автора механизма - ты там свечку держал что ли?
no subject
Date: 2012-11-11 05:40 am (UTC)В поиске на Andrey Solovyev выползает на первое место какой-то генетик из Москвы. Но если мне интересно подсчитать свой индекс цитирования, то я просто в ручную переберу все 13 статей. Я же могу еще искать Solovyev+Curran или Solovyev+Androsov.
Эти механизмы выдуманы то ли по традиции, то ли для того, чтобы показать, что мы можем стрелочками объяснить, как оно получилось. Если бы был другой продукт, то и для него мы могли бы стрелочки нарисовать. Никаким экспериментальным изучением механизма мы не занимались. И это, наверно, даже к лучшему.
no subject
Date: 2012-11-11 05:57 am (UTC)Ну вот такие фиктивные механизмы мне вообще совсем уж не нравятся.
no subject
Date: 2012-11-11 06:27 am (UTC)Петиция на самом деле не такая уж объемная по словам. Лично моих слов там было от силы 3 страницы. Основную массу листов составляют разнообразные дополнения (exhibits), среди которых в том числе первые страницы статей и списки статей их цитирующих. Вот уж не знаю, добрались ли чиновники до всего присланного мной богатства, но рассматривали они мою I-140 четыре дня.
no subject
Date: 2012-11-11 05:50 am (UTC)В WOS можно получить ResercherID, один раз отобрать свои публикации, ну и потом соответственно добавлять в список.
В гугле еще проше. Заведите себе Google Scholar Profile, опять же руками один раз отсортировать, о потом все автоматом считается.
no subject
Date: 2012-11-11 05:55 am (UTC)no subject
Date: 2012-11-11 05:19 am (UTC)А что с механизмами?
no subject
Date: 2012-11-11 05:35 am (UTC)Да ненавижу я их! Что ж там!
no subject
Date: 2012-11-11 05:39 am (UTC)Сайфайндером пользуюсь, или гуглом вообще ))
no subject
Date: 2012-11-11 08:48 am (UTC)А почему ты работал по ночам? Днем было многолюдно?
no subject
Date: 2012-11-11 09:05 am (UTC)И была еще одна хитрость. Я ездил в лабу на велосипеде, и мне не хотелось ехать домой в темноте, особенно уставшим. А тут с вечера придешь, ночью ударно поработаешь, а на рассвете катишь домой отсыпаться. И нет соблазна уйти пораньше.
no subject
Date: 2012-11-11 11:02 am (UTC)no subject
Date: 2012-11-11 08:55 pm (UTC)Имя и фамилия у меня распространенные. Но их часто по-разному транслитерируют на английский.
no subject
Date: 2012-11-11 11:07 pm (UTC)После этого 10 следующих лет (дальше не знаю - не видел) наш хазмат-департмент в здании получил такие полномочия, как Буш в войне с террором после 11 сентября :))
А были ли какие-либо объективные подтверждения хода реакции 6->7? Или это что-то всегда стандартно происходящее, НЕОБРАТИМОЕ и подтверждений не требующее?
no subject
Date: 2012-11-12 02:51 am (UTC)Что касается механизма, то я бы сейчас предложил циклизацию соединения 6 сразу в 3-иминодигидробензотиофен, с последующем депротонированием и таутомеризацией. Тогда превращение 6 в 7 можно вообще избежать, так как перенос гидрида выглядит действительно странно.